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核心簡介:

  癌症轉譯核心設施之相關文件:

Ø   癌症轉譯核心設施儀器借用規則 (PDF文件)

Ø   癌症轉譯核心設施儀器使用認證紀錄表 (PDF文件)

Ø   癌症轉譯核心設施儀器介紹 (PDF文件)

Ø   癌症轉譯核心設施服務項目 (PDF文件)

Ø   轉譯核心設施委託研究樣品及資料領取申請單 (PDF文件)

  核心介紹:

Ø   加值轉譯醫學研究

Ø   輔助臨床診斷及治療

Ø   建立癌症基因庫

Ø   協助臨床試驗之評估

Ø   提供平價而優質的研究服務

  設備列表:(點選可直接連結儀器介紹)

Ø   Illumina MiSeq System 

Ø   Ion PGM™ System

Ø   Agilent 2100 Bioanalyzer system

Ø   QX200 Droplet Digital PCR System

Ø   Covaris M220 (可調式焦距超音波震盪粉碎儀)

Ø   Tissue Homogenizer(組織均質機)

Ø   Cell behavior detection(細胞行為分析)

Ø   IsoFlux

Ø   DEPArray

Ø   Kuiqpick

Ø   Anaerobic bacteria culture(厭氧菌培養)

  提供服務:

Ø   Small Genome Sequencing

Ø   Exome-Sequencing

Ø   Cancer panel Amplicon Sequencing

Ø   Custom Amplicon Sequencing

Ø   CHIP-Sequencing

Ø   Small RNA Sequencing

Ø   Whole transcriptome Sequencing

Ø   mRNA-Sequencing

Ø   Ion AmpliSeq Cancer panel Amplicon Sequencing

Ø   Ion AmpliSeq Custom Primer pools Sequencing

Ø   Sample QC for DNA & RNA (RIN)

  聯絡資訊:

Ø   核心經理:聯合人體生物資料庫  劉韻如主任 TEL: 273616617199

 

  相關檔案:

Ø   基因定序核心設施-服務申請書 

Ø   基因定序核心設施-新一代定序儀使用規範

儀器簡介: 

Illumina MiSeq System 

1.  儀器名稱Illumina MiSeq System

2.  廠牌型號:Illumina, MiSeq

3.  儀器照片:

4.  儀器使用規範:新一代定序儀使用規範

5.  儀器配備:MiSeq 主機一台。

6.  服務項目:

I.  Small Genome Sequencing

II.  Exome-Sequencing

III.  Cancer panel Amplicon Sequencing

IV.  Custom Amplicon Sequencing

V.  CHIP-Sequencing

VI.  Small RNA Sequencing

VII.  Whole transcriptome Sequencing

VIII.  mRNA-Sequencing

7.  儀器地點:癌症轉譯核心設施。

8.  技術員聯絡方式:聯合人體生物資料庫  TEL: 273616617298

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Ion PGMSystem 

1.  儀器名稱Ion PGMSystem

2.  廠牌型號:Life technologies, Ion PGM

3.  儀器照片:

IonPGM 

4.  儀器使用規範:新一代定序儀使用規範

5.  儀器配備:

I.  Ion PGM

II.  Ion OneTouch™ 2 Instrument

III.  Ion OneTouch™ ES

6.  服務項目(Library Preparation & Sequencing)

I.  Ion AmpliSeq Cancer panel Amplicon Sequencing

II.  Ion AmpliSeq Custom Primer pools Sequencing

7.  儀器地點:癌症轉譯核心設施。

8.  技術員聯絡方式:聯合人體生物資料庫 TEL: 273616617298

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Agilent 2100 Bioanalyzer system 

1.  儀器名稱Agilent 2100 Bioanalyzer system

2.  廠牌型號:Agilent, 2100 Bioanalyzer

3.  儀器照片:

4.  儀器使用規範:新一代定序儀使用規範

5.  儀器配備:

I.  Agilent 2100 Bioanalyzer

II.  Bioanlayzer Chip Vortexer, IKA MS 3

6.  服務項目:DNARNA樣品品管

7.  儀器地點:癌症轉譯核心設施。

8.  技術員聯絡方式:聯合人體生物資料庫 TEL: 273616617298

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QX200 Droplet Digital PCR System 

1.  儀器名稱:QX200 Droplet Digital PCR System

2.  廠牌型號:BIO-RAD, QX200 Droplet Digital PCR System

3.  儀器照片

4.  儀器使用規範:數位化微滴分析系統使用規範。

5.  儀器配備:

I.  QX200 droplet generator

II.  QX200 droplet reader

6.  服務項目:

I.  準確檢測複製數量變異性(Copy number variation,CNV)

II.  超微量檢測(Rare Event Detection)

III.  基因表現偵測(Gene expression and miRNA analysis)

IV.  病源偵測(Pathogen detection)

V.  新一代定序樣品建庫之質控(NGS library quantification)

7.  儀器地點:癌症轉譯核心設施。

8.  技術員聯絡方式:聯合人體生物資料庫 TEL: 273616617298

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Covaris M220 (可調式焦距超音波震盪粉碎儀)

1.  儀器介紹:
M220 Focused-ultrasonicator™專為需要片段大小在150bp和5kb之間的下一代測序應用而設計。
Covaris以超聲波頻率(> 400KHz)和非常短的波長 (3毫米),並且獨一無二地將能量集中到樣品中。
Covaris能夠控制將核酸片段化至選定大小的剪切力。整個過程是等溫的,非接觸的,安靜的。

2.  儀器照片:
1198_42c85067.jpg

3.  申請及使用辦法:
I. 請閱讀本單位的使用規則並按照使用規則的指示來使用。
II. 每次登記使用最多以2小時為原則。若需較長時間,請向管理單位申請。

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Tissue Homogenizer (組織均質機)

1.  儀器介紹:
Precellys Evolution是結合高靈活性和高效率的組織均質機。
Evolution均質機可以同時處理五種不同尺寸的管(0.3mL,孔板形式,0.5, 2, 7和15mL)以及同時處理多達24個組織樣本。

2.  儀器照片:
1199_b843a345.jpg

3.  申請及使用辦法:
I. 請閱讀本單位的使用規則並按照使用規則的指示來使用。
II. 每次登記使用最多以2小時為原則。若需較長時間,請向管理單位申請。

-回設備列表-

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Cell behavior detection (細胞行為分析)

1.  儀器介紹:
本系統可同時支援多達3位用戶同時使用細胞檢測分析實驗,支援E-plat和CIM-plate兩種測試板,
可即時偵測細胞生長、細胞遷移和細胞侵犯研究領域。

2.  儀器照片:
1200_220641aa.jpg

3.  申請及使用辦法:
I. 請閱讀本單位的使用規則並按照使用規則的指示來使用。
II. 每次登記使用最多以2小時為原則。若需較長時間,請向管理單位申請。

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IsoFlux

1.  儀器介紹:
IsoFlux System利用微流體技術(Microfluidic channel),使得分選效率增加,
不但保有免疫磁珠法(Magnetic Beads) 的高回收率及靈活度,更提升了細胞通過數量,
有利於分選收集數量極少的罕見細胞,例如circulating tumor cells (CTCs) 的增選分析。

2.  儀器照片:
1201_492c3689.jpg

 

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DEParray

1.  儀器介紹:
DEPArray™系統能夠分離單個完整細胞,使研究人員能夠研究罕見細胞在疾病中的發展,進展和治療反應中的生物學意義。
DEPArray™系統利用成像技術與處理和回收系統的結合可將樣品中單個稀有細胞擷取出來。
這項技術將促進腫瘤學研究,藥物反應和胎兒細胞生物學等領域的進步。

2.  儀器照片:
1202_dc9a4d6e.jpg

 

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Kuiqpick

1.  儀器介紹:
KuiqpicK是一種細胞和組織採集系統,可進行可靠,
精確和經濟實惠的細胞和組織樣品採集,適用於in vitro研究,
包括細胞和區域特異性組織實驗以及單細胞分析。

2.  儀器照片:
1203_88882539.jpg

 

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Anaerobic bacteria culture(厭氧菌培養)

1.  應用範圍:
I. 操作厭氧微生物實驗
II. 厭氧培養箱使用
III. 獨特設計的雙舷窗口,可直接傳送20片培養皿
IV. 全自動濕度和溫度控制系統

2.  儀器照片:
1204_230c4716.jpg

 

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